Dix-huit mois après le premier affrontement de l'U.S.S. Entreprise avec les Borgs - une collectivité d'êtres mi-hommes, mi-machines - la Fédération est menacée. Incapable de se défendre contre cette incroyable menace, Starfleet envoie le lieutenant commander Shelby, spécialiste des cyborgs. La bataille fait rage. La capacité des Borgs à s'adapter à n'importe quelles armes utilisées contre eux montre à quel point la défaite de la Fédération n'est plus qu'une question de temps...