Les missions d’Etopia sont de trois ordres : un travail de prospective, un travail de formation et un travail de mémoire. Ils publient de nombreuses analyses et études, ils éditent des livres et une revue. Actifs dans l’éducation permanente, ils organisent des colloques, des conférences et de nombreuses formations. Ils abritent également un centre de documentation et d’archives qui rassemble ce que l’écologie politique et les mouvements environnementaux ont produit depuis plus de 40 ans. Enfin, ils fournissent une série de services au parti Ecolo et mutualisent leurs services techniques.

Entièrement distinct de son service d’étude, ils sont orientés « long terme et anticipation », à l’écart de l’actualité. Etopia se définit comme une passerelle entre la société civile, la recherche, la militance et le travail politique.